The use of pigs vocalisation structure to assess the quality of human-pig relationship

Studying human-animal interactions in domestic species and how they affect the establishment of a positive Human-Animal Relationship (HAR) may help us improve animal welfare and better understand the evolution of interspecific interactions associated with the domestication process. Understanding and describing the quality of an HAR requires information on several aspects of the animal biology and emotional states (social, spatial and postural behaviours, physiological and cognitive states). Growing evidence shows that acoustic features of animal vocalisations may be indicators of emotional states. Here, we tested the hypothesis that vocal structure may indicate the quality of HAR. At weaning, 30 piglets were positively handled by an experimenter who talked to and physically interacted with them three times a day, while 30 other piglets only received the contact necessary for proper husbandry. After two weeks, we recorded the behaviours and vocalisations produced in the presence of the static experimenter for 5 min. We repeated this test two weeks later, after a conditioning period during which human presence with additional positive contacts was used as a reward for all piglets. We hypothesized this conditioning period would lead to a positive human-piglet relationship for all piglets. As expected, piglets that were positively handled at weaning expressed a higher attraction toward the experimenter, and, after the conditioning, piglets that were not positively handled at weaning expressed a similar level of attraction than the positively handled ones. Piglets positively handled at weaning produced shorter grunts than the other ones, regardless of the context of recording, which may indicate a more positive affect. During reunions with the static experimenter, a more positive HAR was associated with a decrease in vocal reactivity to human proximity. However, during reunions with the experimenter providing additional positive contacts and over the conditioning, spatial proximity to the human systematically triggered shorter and higher pitched grunts, which may indicate a more positive emotional state. Results first show that changes in vocal structure are consistent with indicators of positive states in the presence of a human. Second, these changes are stronger when the human positively interact with the piglets, supposedly emphasizing a higher positive arousal state during these interactions. We show that vocalisation structure may be a promising indicator of the quality of human-pig relationship

Alliance of Proteomics and Genomics to Unravel the Specificities of Sahara Bacterium Deinococcus deserti

To better understand adaptation to harsh conditions encountered in hot arid deserts, we report the first complete genome sequence and proteome analysis of a bacterium, Deinococcus deserti VCD115, isolated from Sahara surface sand. Its genome consists of a 2.8-Mb chromosome and three large plasmids of 324 kb, 314 kb, and 396 kb. Accurate primary genome annotation of its 3,455 genes was guided by extensive proteome shotgun analysis. From the large corpus of MS/MS spectra recorded, 1,348 proteins were uncovered and semiquantified by spectral counting. Among the highly detected proteins are several orphans and Deinococcus-specific proteins of unknown function. The alliance of proteomics and genomics high-throughput techniques allowed identification of 15 unpredicted genes and, surprisingly, reversal of incorrectly predicted orientation of 11 genes. Reversal of orientation of two Deinococcus-specific radiation-induced genes, ddrC and ddrH, and identification in D. deserti of supplementary genes involved in manganese import extend our knowledge of the radiotolerance toolbox of Deinococcaceae. Additional genes involved in nutrient import and in DNA repair (i.e., two extra recA, three translesion DNA polymerases, a photolyase) were also identified and found to be expressed under standard growth conditions, and, for these DNA repair genes, after exposure of the cells to UV. The supplementary nutrient import and DNA repair genes are likely important for survival and adaptation of D. deserti to its nutrient-poor, dry, and UV-exposed extreme environment

Classification of pig calls produced from birth to slaughter according to their emotional valence and context of production

Vocal expression of emotions has been observed across species and could provide a non-invasive and reliable means to assess animal emotions. We investigated if pig vocal indicators of emotions revealed in previous studies are valid across call types and contexts, and could potentially be used to develop an automated emotion monitoring tool. We performed an analysis of an extensive and unique dataset of low (LF) and high frequency (HF) calls emitted by pigs across numerous commercial contexts from birth to slaughter (7414 calls from 411 pigs). Our results revealed that the valence attributed to the contexts of production (positive versus negative) affected all investigated parameters in both LF and HF. Similarly, the context category affected all parameters. We then tested two different automated methods for call classification; a neural network revealed much higher classification accuracy compared to a permuted discriminant function analysis (pDFA), both for the valence (neural network: 91.5%; pDFA analysis weighted average across LF and HF (cross-classified): 61.7% with a chance level at 50.5%) and context (neural network: 81.5%; pDFA analysis weighted average across LF and HF (cross-classified): 19.4% with a chance level at 14.3%). These results suggest that an automated recognition system can be developed to monitor pig welfare on-farm.publishedVersio

Les Bovidae (Mammalia, Artiodactyla) du Pléistocène moyen final de l'aven de Romain-la-Roche (Doubs, France)

Accessible à l'adresse : http://www.ville-ge.ch/mhng/paleo/paleo-pdf/29-2/pal_29_2_07_11.pdfInternational audienceEn même temps qu'un unique reste de chamois Rupicapra cf. rupicapra, 1607 fossiles de grands Bovidae ont été recueillis dans l'aven de Romain-la-Roche. Deux espèces ont pu être identifiées : le bison des steppes Bison priscus priscus (Bojanus, 1827) et l'aurochs Bos primigenius Bojanus, 1827 ; le premier est représenté par 46 restes correspondant à 7 à 11 individus adultes, le second par 32 restes correspondant à 6 à 11 spécimens adultes. Les juvéniles sont nombreux mais n'ont pu être discriminés. Les dimensions des dents et des os longs, des métapodes, des astragales et des calcanéums sont comparées avec celles des Bison priscus, Bison schoetensacki et Bos primigenius du Pléistocène moyen et supérieur et de l'Holocène d'Europe. Les caractères anatomiques des dents associées en rangées et les dimensions et proportions des os sus-cités ont permis de distinguer les deux espèces. Parmi les Bison priscus, la sous-espèce nominale se reconnaît à son cornage et à sa très grande taille. Bison priscus priscus est caractéristique de la partie supérieure du Pléistocène moyen et persiste peut-être dans le Pléistocène supérieur ancien, il correspond à un environnement steppique. Bos primigenius, apparu au début du Pléistocène moyen, a survécu jusqu'à l'Holocène ; ses représentants pléistocènes étaient de très grande taille ; son biotope préférentiel était la prairie-parc boisé. Le degré d'évolution de la population de Bison priscus date le site de la partie supérieure de la zone MNQ 24 (fin du stade isotopique MIS 6), correspondant à peu près à la dernière partie de l'avant-dernière glaciation, ou du début de la zone MNQ 25 (début du dernier interglaciaire). La coexistence de Bison priscus et Bos primigenius montre que le paysage était une mosaïque de steppe froide et de prairie-parc boisé. Bien qu'un peu d'industrie moustérienne ait été trouvée dans le gisement, l'Homme n'est pour rien dans l'accumulation des restes de Bovidae de Romain-la-Roche

« Écrire dans » : Écriture littéraire sur écran. Présentation d’une expérimentation en classe de 3 année du secondaire

International audienceL’article s’appuie sur le cadre théorique de la didactique d’une écriture de l’intertextualité (Houdart-Mérot et Mongenot, 2013), selon le modèle de la greffe discursive que présente Le Goff (2011), sur celui de la génétique textuelle associée à une perspective didactique (Fabre-Cols, 2004 ; Doquet, 2011), et sur celui de l’écriture numérique (Saemmer, 2010, 2015) et des dispositifs d’innovations didactiques qu’elle favorise (écriture sur écran, écriture collaborative). Il se propose d’analyser une expérimentation menée sur une année, dans une classe de 3e année du secondaire : les élèves ont été conduits à écrire directement dans un texte d’écrivain et à opérer des manipulations de ce texte (de types supprimer, déplacer, coller et développer). Ils dialoguent ainsi avec le texte de l’auteur, apprenant de ce tissage qu’ils fabriquent eux-mêmes. Ce dispositif, mené selon différentes modalités, a permis de développer une posture d’auteur engagé dans son texte, ainsi que des compétences d’écriture littéraire

Les écrits de travail numériques au service de l’écriture littéraire

International audienc

Pelloutier, Pouget, Hamon, Lazare et le retour de l’anarchisme au socialisme (1893-1900)

Le socialisme européen est secoué, dans les années 1890-1893, par l’éclosion d’une aile gauche de sensibilité antiparlementaire – SDB aux Pays-Bas, Jungen en Allemagne, POSR en France. Une fraction du mouvement anarchiste va s’y intéresser et tenter une alliance voire une recomposition avec ce courant socialiste, qui permettrait de contester l’hégémonie de la social-démocratie. Du congrès de Zurich (1893) à celui de Paris (1900), un groupe de militants – Pouget, Pelloutier, Lazare, Hamon – va être au cœur de ce processus. La tentative va échouer, mais est révélatrice d’une volonté de l’anarchisme français de « retour au socialisme » à cette époque, et constitue un prélude méconnu à sa période syndicaliste

La voix humaine : une méthode pour apprivoiser les porcs in utero ?

International audienceEn contexte d’élevage, un lien privilégié peut se développer entre le soigneur et les animaux, comme le porc domestique. Sachant que des stimuli sensoriels et des émotions peuvent être transmis à un individu avant la naissance, cette étude visait à déterminer si la familiarisation avec l’homme peut être amorcée avant la naissance via la mère. La perception d’une voix non maternelle, et même non spécifique, in utero et l’impact de cette perception après la naissance ont rarement été étudiés. Pour cela, trois lots de dix truies dans leur dernier mois de gestation ont été soumis à des traitements associant contacts (positifs et négatifs) de l’homme avec diffusion d’une voix (lot A et B) ou non (lot C). Leurs porcelets ont été confrontés à des situations de tests de choix (âge=2 jours ; N=110) et d’open-field (âge=6±1 jours ; N=107) afin d’évaluer l’impact de ces traitements. Les résultats montrent, d’une part, que les truies exprimaient des comportements négatifs en réponse aux contacts négatifs mais des réactions plus positives aux stimuli positifs. Ces réactions sont accrues lorsqu’il n’y a pas d’exposition à la voix de l’homme, avec un effet de l’expérimentateur. D’autre part, les porcelets étaient attirés par les voix dans le test de choix. Ceux privés d’expérience prénatale avec les voix exprimaient globalement plus de comportements de stress pendant la diffusion des voix. Ces comportements étaient dirigés vers la voix de l’expérimentateur négatif avec les mères, et davantage par les porcelets privés d’expérience prénatale avec les voix. Cette étude suggère que la voix humaine pourrait réduire le stress des animaux en élevage. L’état émotionnel associé à la voix (par la truie) a peu d’impact